Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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CASQ1P31415 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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CASQ1P31415 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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CASQ1P31415 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CASQ1P31415 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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