Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX2P28328 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms