Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms