Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PLNP26678 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PLNP26678 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms