Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTX3P26022 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTX3P26022 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms