Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYT1P21579 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT1P21579 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT1P21579 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT1P21579 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms