Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD46P15529 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD46P15529 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD46P15529 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD46P15529 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD46P15529 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD46P15529 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD46P15529 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD46P15529 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD46P15529 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD46P15529 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD46P15529 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD46P15529 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD46P15529 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD46P15529 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD46P15529 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD46P15529 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD46P15529 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD46P15529 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms