Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BRAFP15056 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BRAFP15056 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRAFP15056 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRAFP15056 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms