Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BMP3P12645 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BMP3P12645 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BMP3P12645 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BMP3P12645 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BMP3P12645 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BMP3P12645 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BMP3P12645 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BMP3P12645 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BMP3P12645 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BMP3P12645 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BMP3P12645 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BMP3P12645 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BMP3P12645 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BMP3P12645 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BMP3P12645 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BMP3P12645 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BMP3P12645 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BMP3P12645 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BMP3P12645 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP3P12645 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP3P12645 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms