Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMP4P12644 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMP4P12644 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms