Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms