Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI3P10071 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI3P10071 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI3P10071 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI3P10071 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI3P10071 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI3P10071 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI3P10071 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI3P10071 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI3P10071 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI3P10071 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI3P10071 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI3P10071 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI3P10071 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI3P10071 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI3P10071 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI3P10071 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI3P10071 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI3P10071 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI3P10071 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI3P10071 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI3P10071 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI3P10071 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI3P10071 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI3P10071 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI3P10071 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI3P10071 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI3P10071 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI3P10071 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI3P10071 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI3P10071 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI3P10071 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI3P10071 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI3P10071 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI3P10071 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI3P10071 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI3P10071 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI3P10071 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI3P10071 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI3P10071 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI3P10071 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI3P10071 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI3P10071 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI3P10071 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI3P10071 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI3P10071 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI3P10071 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI3P10071 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI3P10071 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI3P10071 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI3P10071 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI3P10071 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI3P10071 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GLI3P10071 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GLI3P10071 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GLI3P10071 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms