Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC172P0C7W6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC172P0C7W6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC172P0C7W6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC172P0C7W6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC172P0C7W6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC172P0C7W6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC172P0C7W6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC172P0C7W6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC172P0C7W6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC172P0C7W6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC172P0C7W6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC172P0C7W6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC172P0C7W6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC172P0C7W6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC172P0C7W6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC172P0C7W6 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC172P0C7W6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC172P0C7W6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC172P0C7W6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC172P0C7W6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC172P0C7W6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC172P0C7W6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms