Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSLP07711 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTSLP07711 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTSLP07711 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTSLP07711 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSLP07711 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSLP07711 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSLP07711 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSLP07711 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSLP07711 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSLP07711 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSLP07711 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSLP07711 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSLP07711 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSLP07711 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms