Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX7O95931 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX7O95931 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms