Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNJ1O43426 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNJ1O43426 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNJ1O43426 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNJ1O43426 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNJ1O43426 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNJ1O43426 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNJ1O43426 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNJ1O43426 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNJ1O43426 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNJ1O43426 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNJ1O43426 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNJ1O43426 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNJ1O43426 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNJ1O43426 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNJ1O43426 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNJ1O43426 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNJ1O43426 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNJ1O43426 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms