Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA2O43364 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms