Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRTO14522 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms