Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms