Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAPRE3Q9UPY8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms