Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX6Q9UNH7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms