Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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FOXD3Q9UJU5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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FOXD3Q9UJU5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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FOXD3Q9UJU5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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FOXD3Q9UJU5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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FOXD3Q9UJU5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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FOXD3Q9UJU5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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FOXD3Q9UJU5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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FOXD3Q9UJU5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXD3Q9UJU5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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