Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI46

DNAI1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAI1Q9UI46 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAI1Q9UI46 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms