Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DKK4Q9UBT3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK4Q9UBT3 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms