Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFIP11Q9UBB9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms