Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms