Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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