Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms