Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms