Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms