Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms