Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SIRT1Q96EB6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms