Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT7

CCDC124, Coiled-coil domain-containing protein 124, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC124Q96CT7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC124Q96CT7 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC124Q96CT7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC124Q96CT7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC124Q96CT7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC124Q96CT7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC124Q96CT7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC124Q96CT7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC124Q96CT7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC124Q96CT7 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC124Q96CT7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC124Q96CT7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC124Q96CT7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC124Q96CT7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC124Q96CT7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC124Q96CT7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC124Q96CT7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC124Q96CT7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC124Q96CT7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC124Q96CT7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC124Q96CT7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC124Q96CT7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC124Q96CT7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC124Q96CT7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC124Q96CT7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC124Q96CT7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms