Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms