Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms