Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB13Q92826 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB13Q92826 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms