Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms