Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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