Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms