Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD35Q8N283 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD35Q8N283 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD35Q8N283 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD35Q8N283 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD35Q8N283 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD35Q8N283 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD35Q8N283 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD35Q8N283 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD35Q8N283 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD35Q8N283 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD35Q8N283 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD35Q8N283 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD35Q8N283 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD35Q8N283 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms