Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HACE1Q8IYU2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HACE1Q8IYU2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HACE1Q8IYU2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HACE1Q8IYU2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HACE1Q8IYU2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HACE1Q8IYU2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HACE1Q8IYU2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HACE1Q8IYU2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HACE1Q8IYU2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HACE1Q8IYU2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HACE1Q8IYU2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HACE1Q8IYU2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HACE1Q8IYU2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HACE1Q8IYU2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HACE1Q8IYU2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HACE1Q8IYU2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HACE1Q8IYU2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HACE1Q8IYU2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HACE1Q8IYU2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HACE1Q8IYU2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HACE1Q8IYU2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACE1Q8IYU2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms