Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYT9Q86SS6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms