Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI25

CNIH2, Protein cornichon homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH2Q6PI25 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNIH2Q6PI25 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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CNIH2Q6PI25 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CNIH2Q6PI25 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CNIH2Q6PI25 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNIH2Q6PI25 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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