Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms