Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms