Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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