Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms