Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPE65Q16518 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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