Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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EXT1Q16394 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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EXT1Q16394 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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EXT1Q16394 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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EXT1Q16394 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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EXT1Q16394 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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EXT1Q16394 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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EXT1Q16394 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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EXT1Q16394 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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EXT1Q16394 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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EXT1Q16394 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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EXT1Q16394 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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EXT1Q16394 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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EXT1Q16394 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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EXT1Q16394 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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EXT1Q16394 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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