Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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ZNF56Q15929 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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ZNF56Q15929 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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ZNF56Q15929 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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ZNF56Q15929 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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ZNF56Q15929 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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ZNF56Q15929 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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ZNF56Q15929 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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ZNF56Q15929 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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ZNF56Q15929 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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ZNF56Q15929 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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